对性侵犯受害者（包括强奸受害者）的医学评估应采用创伤知情护理原则进行（1）。性侵犯后的医学评估目标是
受伤的医疗评估和治疗以及妊娠和性传播感染的评估、治疗和预防
收集法庭证据
心理评估
心理治疗和支持的建议
在进行医学评估之前，应建议病人：不要扔掉或更换衣服，洗澡或冲淋，刷牙，剪指甲或漱口，因为这样做会破坏证据。
只要有可能，任何遭受强奸的受害者应转诊至当地处理强奸的诊疗中心，通常是医院的急诊部门。这样的部门配备有经过特殊培训的职业工作者（如，性骚扰检查护士[SANE]）。美国的一些地区设有性侵犯反应小组（SART），其中包括来自卫生保健，法医，当地强奸处理中心，执法部门和检察官办公室的成员。解释了性侵犯评估的好处，但患者可以自由同意或拒绝评估。一旦患者同意评估，需通知警方。大多数患者都会受到创伤的影响，他们的护理需要敏感、同理心和同情心。患者可能会对同性的医生感到更舒适;所有患者在检查前应询问他们的要求。所有男医生检查女性患者时，必需有一名女性工作人员陪同。尽可能地给患者提供一个保密且安静的检查环境。
用于记录法律证据和医疗结果的表格(有时是性侵犯证据收集工具的一部分)(表格中的典型要素见表 性侵犯指控的典型检查);它应该适应当地的要求。由于医学记录可能被应用于法庭，医学结果的书写需符合法律规范，并使用能被法官理解的非专业性语言。
表格涉嫌性侵的典型检查表格 涉嫌性侵的典型检查
分类
具体描述
一般信息
患者的人口统计学信息
监护人姓名、地址、电话（如果患者未成年）
警员的名字、警徽编号和部门
检查日期、时间和地点
病史
受攻击的环境，包括
日期、时间和地点
袭击者资料（人数、姓名（如果患者知道的话），特征）
使用威胁、控制、武器
性接触的类型（阴道、口腔、直肠；使用避孕套 ）
外生殖器损伤的类型
是否出血（患者或攻击者的）
攻击者是否射精及部位
患者被侵犯后的活动，如：
冲洗或洗澡
使用棉条或卫生巾
排尿、排便
换衣服
进食或饮水
使用牙膏、漱口、灌肠剂或药物
末次月经
上次性行为的日期和时间（如果最近）
避孕史（如口服避孕药、宫内节育器）
体格检查
（生殖器外）任何地方损伤
会阴部、处女膜、外阴、阴道、宫颈或肛门部的创伤
身体上的异物（如染料、头发、泥土、小树枝等）
如有条件，使用Wood's灯或阴道镜检查
资料收集
衣服的情况（如损坏，染色、其他物体附着）
衣服的小块样品，包括未弄脏的样品，送至警方或实验室
头发标本，包括掉下的粘附于患者或布衣料上的毛发，有精液的阴毛，和剪取患者头发和阴毛（至少10根作对比）
从宫颈、阴道、直肠、口和大腿处取得的精液
患者的血样
从患者身体和衣服取得的攻击者的干的血样本
尿
唾液
口腔黏膜涂片
剪下的手指甲和指甲屑
其他标本，按照病史或体格检查的要求
实验室检查
酸性磷酸酯酶用于检测精子的存在*
阴道的生理盐水悬浮液†（检测精子活动性）
精液分析用于分析精子形态和A，B或H血型组分的存在与否‡
患者的梅毒血清学检测§
患者进行其他性传播疾病的基线检测§
血型检测（用患者的血和攻击者干的血样本）
尿液检测，包括药物筛查||和妊娠试验
其他检查，按照病史或体格检查的要求
治疗，转诊，医生的临床评价
记录在病历中
检查者
所需表格上的签名
证据保存
证据寄信人和收信人的名字
寄信和收信的日期，时间
*这个试验特别适用于攻击者做过输精管切除术，或患少精症，或使用避孕套者而导致精子缺乏。假如不能马上做这个试验，标本应放在冷冻箱内。
†这个检查应及时由医师检测以查出活动的精子。
‡在80%的病例中，精液中可发现血型物质。
§并不是所有的机构推荐这项检查，因为之前存在的性传播疾病的证据可能会被用来在法庭上诋毁患者。
||许多机构建议不要评估或检测病人体内是否含有酒精或药物，因为醉酒在法庭上是不利于病人的证据。
病史与检查检查开始前，检查者需征得病人的同意。因为重温事件常使病人感到恐惧和尴尬，检查者必须安慰、同情病人，不能带有评判的眼光，而且不能催促患者。应确保保密性。检查者应仔细检查以下细节，包括
创伤的类型（尤其是嘴，乳房，阴道和直肠部位）
病人或攻击者有无出血或撕裂伤（用于评估被传染HIV或肝炎的危险性）
攻击的描述（如处女膜是否被穿破和是否射精或是否使用避孕套）
攻击者的侵犯、威胁、武器和暴力行为
对攻击者的描述
许多性侵犯报告表格包括大部分或所有这些要素（见表格 性侵犯指控的典型检查）。患者应被告知为什么要回答上述问题（例如关于了解避孕措施的信息有助于判断强奸后妊娠的风险；前次性交的信息有助于判断精子检测的有效性）。
检查应在每一步前进行解释；患者可以拒绝检查的任何部分。应与病人一起回顾检查的结果。如果可以，对于损伤应尽可能存照。应仔细检查嘴、乳房、生殖器和直肠部位。女性常见的损伤部位包括小阴唇和阴道后壁。用Wood's灯检查也许可发现皮肤上的精液或碎屑。阴道镜检查对于检测微小的生殖器损伤尤其敏感。一些阴道镜带有摄像头，使发现并对损伤处进行拍照成为可能。应用甲苯胺蓝染色突出显示创伤部位，能否作为证据取决于司法机构。
检查和证据收集常规检测包括妊娠试验和梅毒、乙型肝炎和艾滋病毒的血清学检测；如果在性侵犯发生后的几个小时内进行，这些测试会提供有关性侵犯前怀孕或感染的信息，但不会提供性侵犯后发生的信息。对阴道分泌物或尿液进行滴虫性阴道炎和细菌性阴道病检测；对于任何可能被插入的孔腔（阴道，口腔或直肠）应采集样本进行淋病和衣原体检测（2)。患者可能会拒绝 STI 检测，这可能是因为通常对所有患者进行经验性治疗。
进行后续测试以检查怀孕和性传播感染：
1 周时：拒绝预防性治疗的患者出现淋病、衣原体感染和滴虫病
2 周时：怀孕
4至6周时：梅毒和HIV感染
在第3个月检测梅毒、肝炎和HIV感染
如果患者对性侵犯期间的事件有健忘症，则应考虑对氟硝西泮（约会强奸药）和γ-羟基丁酸进行药物筛查。药物滥用和酒精的检查是有争议的，因为醉酒的证据能损害患者的名誉。
上阴道严重撕裂伤的患者，尤其是儿童，可能需要腹腔镜检查来确定损伤的深度。
收集可以证明性侵犯的证据（见表格 性侵犯指控的典型检查）；它通常包括
衣着
口腔、阴道和直肠黏膜的污迹
梳理头皮和阴毛样本以及对照样本（取自患者）
剪下的手指甲和手指甲屑
血液和唾液样本
如果有的话，精液
在市面上有很多种类的证物收集工具包，有时需要特殊的工具包。在洗澡、更衣、冲洗后，证据通常不能被找到或具有不确定性。随着时间推移，尤其>36个小时后，上述证据逐渐减弱或消失;然而，根据司法管辖区的不同，证据可以在性侵犯后7天内收集。
证物保管人（证物在具体何人的手里）的名单，应一直保留。而且，每个样本应放入单独样本袋中，贴好标签，注明日期后密封，并妥善保管直至移交给他人（通常是执法人员或实验室人员），并让其签好收据。在一些司法管辖区域，收集标本进行DNA测试来辨认攻击者需要一些特定的授权。
临床医生应鼓励患者寻求帮助以管理其创伤的影响并恢复其功能（危机干预）并寻求心理支持。